工藤新一怎么也沒想到，自己只是跟蹤兩個(gè)神秘黑衣人，就被人從背后打暈，
強(qiáng)行灌下了一種神秘的藥物。當(dāng)他再次醒來時(shí)，身體竟不可思議地縮小成了小孩模樣。
看著鏡子里陌生的孩童面容，新一驚恐又慌亂，他知道如果黑衣組織發(fā)現(xiàn)自己還活著，
不僅自己性命難保，身邊的人也會(huì)陷入危險(xiǎn)之中。在思考該如何應(yīng)對這突如其來的變故時(shí)，
他想起了阿笠博士。新一急忙跑到阿笠博士家，好在博士相信了他荒誕離奇的經(jīng)歷。
兩人正商討對策時(shí)，門外傳來了一陣急促的敲門聲。新一躲了起來，阿笠博士打開門，
發(fā)現(xiàn)是毛利蘭因?yàn)橐恢甭?lián)系不上新一，擔(dān)心他出事，所以來找博士詢問情況。
看到焦急的毛利蘭，新一靈機(jī)一動(dòng)，在博士的配合下，編造了自己是“江戶川柯南”，
父母雙亡，暫居親戚家卻被虐待，所以逃出來的謊言。善良的毛利蘭一聽，
立馬就同情心泛濫，拉著柯南說要帶他回家，至少先有個(gè)容身之所。來到毛利偵探事務(wù)所，
毛利小五郎正翹著二郎腿，喝著啤酒，看著無聊的電視節(jié)目。“老爸，這是柯南，
他現(xiàn)在無家可歸，我們先收留他吧?！泵m說道。小五郎瞥了柯南一眼，
不耐煩地說：“小蘭，我們家又不是慈善機(jī)構(gòu)，哪能隨便收留人。”“爸爸！
”毛利蘭撒嬌地晃著小五郎的胳膊，“他好可憐的，就先讓他住下嘛。
”在毛利蘭的再三懇求下，小五郎才勉強(qiáng)同意?？履闲睦锇蛋邓闪丝跉?，
終于有了一個(gè)相對安全的落腳點(diǎn)，而且這里還是偵探事務(wù)所，
說不定能收集到有關(guān)黑衣組織的線索。然而，沒過幾天，小五郎就卷入了一起棘手的案件。
一位富商在家中遇害，種種證據(jù)都指向了小五郎。原來，案發(fā)當(dāng)晚，小五郎曾受雇于富商，
去調(diào)查其夫人的出軌對象，而在他離開后不久，富商就被殺害了。
警方在現(xiàn)場發(fā)現(xiàn)了小五郎遺落的打火機(jī)，而且據(jù)鄰居證詞，
當(dāng)晚還聽到了小五郎和富商激烈的爭吵聲。小五郎被帶到警局后，
大聲喊冤：“我真的沒有殺人！我只是去和他說了調(diào)查的結(jié)果，雖然我們有爭執(zhí)，
但我離開的時(shí)候他還好好的！”但警方并不相信他的辯解，畢竟證據(jù)擺在眼前。
小蘭急得直掉眼淚，她堅(jiān)信父親不會(huì)殺人?？履弦灿X得事情有些蹊蹺，以他對小五郎的了解，
雖然這個(gè)叔叔愛喝酒、愛美女，但絕不是會(huì)殺人的人。于是，柯南決定暗中調(diào)查這個(gè)案件，
還小五郎一個(gè)清白。柯南重新勘察了案發(fā)現(xiàn)場，在一個(gè)隱蔽的角落發(fā)現(xiàn)了一些細(xì)微的纖維，
與現(xiàn)場任何物品的材質(zhì)都不匹配。他還發(fā)現(xiàn)窗戶有被撬動(dòng)過的痕跡，
而警方之前卻忽略了這個(gè)細(xì)節(jié)。通過走訪調(diào)查，
柯南得知富商夫人的出軌對象是一個(gè)有前科的混混，而且最近因?yàn)楦簧桃头蛉穗x婚，
斷了他的財(cái)路，他曾揚(yáng)言要給富商一點(diǎn)顏色瞧瞧。柯南將這些線索串聯(lián)起來，
終于推理出了真相。原來，那個(gè)混混在小五郎離開后，從窗戶潛入富商家中，殺害了富商，
并故意留下小五郎的打火機(jī)，偽造了現(xiàn)場，企圖嫁禍給小五郎。在柯南的引導(dǎo)下，
小蘭帶著警方找到了關(guān)鍵證據(jù)，最終混混被繩之以法，小五郎得以洗刷冤屈。經(jīng)過這件事，
小五郎對柯南的態(tài)度有了很大轉(zhuǎn)變，雖然嘴上還是會(huì)嫌棄柯南是個(gè)麻煩小鬼，
但心里已經(jīng)開始認(rèn)可這個(gè)機(jī)靈的孩子。而柯南也正式在毛利家住了下來，
開始了一邊尋找黑衣組織線索，一邊協(xié)助小五郎破案的生活?？履隙自诎赴l(fā)現(xiàn)場的飄窗下，
用放大鏡反復(fù)觀察窗框上的劃痕。陽光透過紗簾在灰塵上投下蛛網(wǎng)般的紋路，
當(dāng)他發(fā)現(xiàn)劃痕邊緣帶著新鮮木屑時(shí)，瞳孔驟然收縮——這分明是案發(fā)當(dāng)晚才留下的撬動(dòng)痕跡！
"小鬼別亂跑！"目暮警官一把拎起柯南，"重要證物區(qū)不許隨便進(jìn)。
"柯南故意把滑板甩在地板上，趁眾人目光被聲響吸引時(shí)，
將粘在指尖的藍(lán)色纖維悄悄抹在小五郎的袖口。等小蘭過來抱走他時(shí)，
他突然指著小五郎袖口驚呼："叔叔袖子上有奇怪的毛毛！和剛才我在窗戶縫里看到的好像！
"毛利小五郎頓時(shí)跳腳："開什么玩笑！我怎么可能......"他的聲音戛然而止，
因?yàn)槟磕壕僖呀?jīng)臉色凝重地掏出證物袋?？履铣脵C(jī)拽住小蘭的衣角："大姐姐，
窗戶那邊的灰塵腳印好像和叔叔的皮鞋花紋不一樣呢。"深夜的事務(wù)所里，
柯南趴在桌上寫寫畫畫。當(dāng)小五郎醉醺醺回來時(shí)，他故意把草稿紙揉成團(tuán)扔進(jìn)垃圾桶。
果不其然，等小五郎哼著跑調(diào)的歌翻找威士忌時(shí)，瞥見了紙上用蠟筆繪制的犯罪現(xiàn)場平面圖，
特別是那個(gè)被紅圈圈起來的飄窗標(biāo)記。"這小鬼......"小五郎皺著眉頭展開紙團(tuán)，
突然想起白天柯南的異常舉動(dòng)。他摸出自己的偵探手冊，
在"窗戶線索"后面重重畫了個(gè)問號。第二天，柯南跟著小五郎重返現(xiàn)場。
當(dāng)看到死者書房里被打翻的魚缸時(shí)，他故意用足球踢翻清潔工具，
清潔劑泡沫濺到地毯上的某處，瞬間泛起詭異的紫色——那是魯米諾試劑才會(huì)有的反應(yīng)！
"等等！"小五郎突然叫停正在收隊(duì)的警察，"重新檢測地毯上的血跡分布！
尤其是魚缸附近！"他學(xué)著柯南的樣子蹲下身，發(fā)現(xiàn)魚缸底座邊緣沾著半枚模糊的指紋。
經(jīng)過連夜比對，指紋屬于死者夫人的情人張川。當(dāng)警方包圍他的出租屋時(shí)，
這個(gè)慣犯還在擦拭沾血的棒球棍。面對鐵證，他終于供認(rèn)：案發(fā)當(dāng)晚，
他趁小五郎離開后從飄窗潛入，本想勒索錢財(cái)，卻因言語沖突失手殺人，
隨后用小五郎遺落的打火機(jī)偽造現(xiàn)場。"干得漂亮啊毛利老弟！
"目暮警官拍著小五郎的肩膀。醉醺醺的偵探撓著頭傻笑，
突然瞥見躲在小蘭身后比耶的柯南。那小鬼狡黠的目光讓他心里咯噔一下——這場反轉(zhuǎn)，
恐怕沒那么簡單?？履贤h(yuǎn)處閃爍的警燈，悄悄把藏在口袋里的微型竊聽器捏得更緊了些。
月光下，黑衣組織的謎團(tuán)依然籠罩著這座城市，但他知道，每破解一個(gè)案件，
就離真相更近一步。情人節(jié)的氣息像融化的巧克力般彌漫在米花町街頭，
柯南望著便利店貨架上堆滿的心形禮盒，突然被毛利蘭一把拎起：“柯南，幫我選巧克力！
”玻璃櫥窗映出小蘭微紅的臉頰，她正對著手工巧克力區(qū)猶豫不決。
柯南踮腳看到包裝盒上印著“戀人限定”的字樣，心里莫名發(fā)緊。就在這時(shí)，
灰原哀抱著一摞推理小說路過，鏡片閃過冷光：“需要我提醒某位偵探，
今天可能會(huì)有案件發(fā)生哦？”果然，當(dāng)天下午偵探事務(wù)所的電話就響了。
珠寶大亨的女兒鈴木園子哭著打來求救，
說自己準(zhǔn)備在情人節(jié)派對上送給京極真的定情項(xiàng)鏈不翼而飛，更詭異的是，
派對現(xiàn)場還出現(xiàn)了用血畫成的玫瑰圖案。柯南和小蘭趕到鈴木家時(shí)，宴會(huì)廳里一片混亂。
園子揪著毛利小五郎的衣領(lǐng)：“叔叔！一定要在京極來之前找到項(xiàng)鏈，不然我死定了！
”小五郎漲紅著臉要拍胸脯保證，卻被柯南踩了下腳背?！敖憬?，
項(xiàng)鏈消失前有沒有特別的人靠近過？”柯南眨著無辜的大眼睛問道。
園子突然捂住嘴：“對了！有個(gè)戴著口罩的服務(wù)生送過香檳，之后項(xiàng)鏈就不見了！
”柯南在現(xiàn)場展開地毯式搜索，在通風(fēng)管道口發(fā)現(xiàn)了一枚袖扣。正當(dāng)他準(zhǔn)備爬上梯子查看時(shí)，
毛利蘭突然出現(xiàn)把他抱下來：“危險(xiǎn)！這種事交給大人?！闭f著就要自己爬上去，
柯南急得直拽她衣角：“大姐姐！管道口有指甲油痕跡，犯人可能是女性！”經(jīng)過一番推理，
真相逐漸浮出水面。犯人竟是園子的表姐，她因嫉妒妹妹的感情，策劃了這場鬧劇，
想用假血制造恐慌掩蓋偷項(xiàng)鏈的事實(shí)。當(dāng)柯南用變聲器引導(dǎo)小五郎指出真兇時(shí)，
園子已經(jīng)哭成了淚人?！皥@子！”京極真的聲音突然從門口傳來，
這位格斗高手捧著一束紅玫瑰，脖子上卻戴著那條丟失的項(xiàng)鏈，“在門口撿到這個(gè)，
還以為是你準(zhǔn)備的驚喜?！毕﹃栁飨聲r(shí)，柯南看著手挽手說笑的園子和京極真，
悄悄松了口氣。毛利蘭突然蹲下來，把一個(gè)包裝精美的小盒子塞給他：“柯南也有份哦！
雖然是小朋友，但情人節(jié)巧克力不能少?！碑?dāng)晚，小蘭接到了和葉、園子的電話，
約她去參加女子限定的情人節(jié)聚會(huì)。看著小蘭哼著歌出門的背影，柯南咬了口巧克力，
甜膩的滋味里帶著淡淡的惆悵。月光灑在事務(wù)所的窗臺，
他握緊了口袋里那枚沒送出去的卡通巧克力——有些心意，注定要藏在偵探的謎題里。
深夜的阿笠博士家，柯南抱著案件資料昏昏欲睡，突然被一陣玻璃器皿碰撞聲驚醒。
他揉著眼睛走向?qū)嶒?yàn)室，
哀清冷的聲音：“APTX4869的解藥實(shí)驗(yàn)又失敗了……”柯南屏住呼吸透過門縫望去，
月光下，灰原哀摘下標(biāo)志性的紅框眼鏡，露出與往日截然不同的哀傷神情。
她手中的平板電腦亮起幽藍(lán)光芒，屏幕上赫然是黑衣組織的標(biāo)志，
以及密密麻麻的藥物研究數(shù)據(jù)?！皩m野志?！笨履夏钪@個(gè)熟悉又陌生的名字。
他終于明白，為何灰原總能精準(zhǔn)指出案件關(guān)鍵，為何她對黑衣組織的行動(dòng)了如指掌。
原來這個(gè)看似冷漠的女孩，竟是制造出讓他身體縮小藥物的核心成員。第二天在帝丹小學(xué)，
柯南試圖旁敲側(cè)擊?；以s像看透他心思般，將一顆糖塞進(jìn)他嘴里：“江戶川同學(xué)，
有些真相知道得太早，可是會(huì)嘗到苦澀的滋味哦。”隨著調(diào)查深入，
柯南在博士家的暗格里發(fā)現(xiàn)了灰原哀的日記。泛黃的紙頁上記錄著她在組織的過往，
還有那句刺痛人心的話：“我親手毀掉了那么多人的人生，包括工藤新一……”一個(gè)暴雨夜，
黑衣組織的殺手突然襲擊博士家。千鈞一發(fā)之際，灰原哀擋在柯南身前，她的外套被劃破，
露出鎖骨處醒目的組織刺青?！澳愎皇菍m野志保！”柯南攥緊拳頭。灰原哀卻冷笑一聲，
舉起手中的麻醉槍：“偵探先生，現(xiàn)在可不是敘舊的時(shí)候。”危機(jī)解除后，
灰原哀獨(dú)自站在陽臺上，望著城市的霓虹沉默不語?？履献叩剿砗螅骸盀槭裁床桓嬖V我？
”“因?yàn)槲液ε?。”灰原哀難得露出脆弱的一面，“害怕你知道真相后，
會(huì)像組織那些人一樣，把我當(dāng)成怪物……”柯南摘下眼鏡，
月光映出他堅(jiān)定的眼神：“你只是個(gè)想找回正常生活的女孩，就像我想變回工藤新一一樣。
從今天起，我們不只是搭檔，更是同伴。”灰原哀微微一怔，
隨即恢復(fù)了往日的淡然：“說好了，偵探。要是你敢拖后腿，我可不會(huì)手下留情?！币股校?/p>
兩個(gè)小小的身影并肩而立。柯南知道，揭開灰原哀的真實(shí)身份，
只是通往黑衣組織真相的第一步。而他們的羈絆，也將在未來的無數(shù)個(gè)案件中，愈發(fā)深刻。
陽光透過帝丹小學(xué)的玻璃窗灑進(jìn)教室，柯南和少年偵探團(tuán)的孩子們圍坐在課桌旁，
桌上擺滿了手工課要用的彩紙、膠水和剪刀。步美捧著一張粉色卡紙，
眼睛亮晶晶地說：“我們來折愛心吧！聽說折滿一百個(gè)，愿望就能實(shí)現(xiàn)！
”元太嘴里塞著鰻魚飯飯團(tuán)，含糊不清地說：“我要折個(gè)超級大的鰻魚飯，
這樣就永遠(yuǎn)都吃不完啦！”光彥推了推眼鏡，煞有介事地反駁：“科學(xué)證明，
折紙并不能變成實(shí)物。不過我們可以做個(gè)偵探徽章！”柯南看著吵吵鬧鬧的伙伴們，
嘴角不自覺地上揚(yáng)。雖然身體縮小后有諸多不便，但和這群天真爛漫的孩子在一起，